Terluka di ambang kematian dan menderita amnesia, Jason Bourne diselamatkan di laut oleh seorang nelayan. Dengan tidak ada yang bisa dilakukan selain nomor rekening bank Swiss, ia mulai merekonstruksi hidupnya, tetapi menemukan bahwa banyak orang yang ia temui menginginkannya mati. Namun, Bourne menyadari bahwa ia memiliki pertempuran dan keterampilan mental dari mata-mata kelas dunia-tetapi untuk siapa ia bekerja?