Dunia adalah misteri yang membingungkan dan damai bagi amélie hingga pertemuan ajaib dengan coklat menyulut rasa ingin tahunya yang liar. Saat ia mengembangkan keterikatan yang mendalam dengan pengurus rumah tangga keluarganya, Nishio-san, Amélie menemukan keajaiban alam serta kebenaran emosional yang tersembunyi di balik permukaan kehidupan indah keluarganya sebagai orang asing di Jepang pascaperang.